Cabecera 2 940 CBMSO CSIC UAM

Miércoles, 14 de Noviembre de 2018

Dinámica y función del genoma

    Regulación de la expresión génica en Leishmania

 

 

 FotoGrupo 26Jul17

 


José María Requena Rolanía 

ECompogrupo

EListado

Resumen de Investigación:

 

La actividad del grupo está dirigida al estudio de aspectos moleculares del protista Leishmania, y de la inmunopatología que produce al infectar al huésped. Por un lado, hemos continuado estudiando procesos moleculares responsables de la peculiar manera en que este organismo regula la expresión génica, que ocurre en ausencia de regulación transcripcional. Por otro lado, hemos trabajado en el desarrollo de estrategias para el control de la leishmaniasis, una enfermedad que afecta a millones de personas.

 

Mediante técnicas de secuenciación masiva, estamos estableciendo los transcriptomas de varias especies de Leishmania (y mejorando las anotaciones genómicas) con la meta de identificar elementos reguladores, frecuentemente localizados en las regiones 3’ no traducidas de los mRNAs, y de proteínas de unión a RNA, claves en la regulación de la expresión génica. Este proyecto está siendo realizado en estrecha colaboración con la Dra Begoña Aguado (CBMSO). Para dar visibilidad a los resultados de nuestros estudios y facilitar la utilización de los datos generados, hemos diseñado la página Web Leish-ESP (http://leish-esp.cbm.uam.es/).

 

En la parcela sobre aspectos inmunopatológicos de la infección por Leishmania, dirigida por el Dr Manuel Soto, hemos avanzado en la caracterización de factores del parásito que interfieren con la respuesta inmunitaria del huésped. Asimismo, se han evaluado nuevas estrategias para el tratamiento y diagnóstico, y ensayado candidatos vacunales, en base al análisis de muestras procedentes de pacientes humanos y caninos, y al uso de infección experimental en modelos animales. Además, venimos participando en un Proyecto financiado por la comisión europea (FP7), titulado “Clinical Studies on a Multivalent Vaccine for Human Visceral Leishmaniasis” (MuLeVaClin) y que tiene como objetivo el desarrollo de una vacuna frente a la leishmaniasis visceral humana. Información adicional en el siguiente enlace: http://www.mulevaclin.eu. Finalmente, indicar que nuestro grupo pertenece a la red de enfermedades Tropicales del ISCIII: RICET (http://www.ricet.es).

 

 

fig01.300px

 La regulación de la expresión génica en Leishmania ocurre a nivel postranscripcional

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


 

Publicaciones recientes:

    • Requena, J.M., Chicharro, C., Garcia, L., Parrado, R., Puerta, C.J. and Cañavate, C. (2012). Sequence analysis of the 3'-untranslated region of HSP70 (type I) genes in the genus Leishmania: its usefulness as a molecular marker for species identification. Parasites & Vectors 5: 87. PMID: 22541251
    • Rastrojo, A., Carrasco-Ramiro, F., Martín, D., Crespillo, A., Reguera, R.M., Aguado, B. and Requena, J.M. (2013). The transcriptome of Leishmania major in the axenic promastigote stage: transcript annotation and relative expression levels by RNA-seq. BMC Genomics 14(1):223. PMID: 23557257
    • Fraga, J., Montalvo, A.M., Van der Auwera, G., Maes, I., Dujardin, J.C., and Requena, J.M. (2013). Evolution and species discrimination according to the Leishmania heat-shock protein 20 gene. Infect Genet Evol 18: 229-237. PMID: 23722022
    • Ramirez, C.A., Requena, J.M., and Puerta, C.J. (2013). Alpha tubulin genes from Leishmania braziliensis: genomic organization, gene structure and insights on their expression. BMC Genomics 14, 454. PMID: 23829570
    • Ramirez, C.A., Dea-Ayuela, M.A., Gutierrez-Blazquez, M.D., Bolas-Fernandez, F., Requena, J.M., and Puerta, C.J. (2013). Identification of proteins interacting with HSP70 mRNAs in Leishmania braziliensis. J. Proteomics 94: 124-137. PMID: 24060997
    • Montalvo, A.M., Fraga, J., Rodriguez, O., Blanco, O., Llanos-Cuentas, A., Garcia, A.L., Valencia, B.M., Muskus, C., Van der Auwera, G., and Requena, J.M. (2014). Detección de Leishmania spp. en base al gen que codifica la proteína HSP20. Rev Peru Med Exp Salud Publica 31: 635-643. PMID: 25597712
    • Nocua, P.A., Ramirez, C.A., Barreto, G.E., Gonzalez, J., Requena, J.M., and Puerta, C.J. (2014). Leishmania braziliensis replication protein A subunit 1: molecular modelling, protein expression and analysis of its affinity for both DNA and RNA. Parasites & Vectors 7: 573. PMID: 25498946
    • Requena, J.M., Montalvo, A.M., and Fraga, J. (2015). Molecular Chaperones of Leishmania: Central Players in Many Stress-Related and -Unrelated Physiological Processes. Biomed Res Int 2015: 301326. PMID: 26167482
    • Alonso, G., Rastrojo, A., Lopez-Perez, S., Requena, J.M., and Aguado, B. (2016). Resequencing and assembly of seven complex loci to improve the Leishmania major (Friedlin strain) reference genome. Parasites & Vectors 9: 74. PMID: 26857920
    • Fernandez-Orgiler, A., Martinez-Jimenez, M.I., Alonso, A., Alcolea, P.J., Requena, J.M., Thomas, M.C., Blanco, L., and Larraga, V. (2016). A putative Leishmania DNA polymerase theta protects the parasite against oxidative damage. Nucleic Acids Res 44: 4855-4870. PMID: 27131366
    • Lombraña, R., Alvarez, A., Fernandez-Justel, J.M., Almeida, R., Poza-Carrion, C., Gomes, F., Calzada, A., Requena, J.M., and Gomez, M. (2016). Transcriptionally Driven DNA Replication Program of the Human Parasite Leishmania major. Cell Rep 16: 1774-1786. PMID: 27477279
    • Requena, J.M., Rastrojo, A., Garde, E., Lopez, M.C., Thomas, M.C., and Aguado, B. (2017). Genomic cartography and proposal of nomenclature for the repeated, interspersed elements of the Leishmania major SIDER2 family and identification of SIDER2-containing transcripts. Mol Biochem Parasitol 212, 9-15. PMID: 28034676
    • Requena, J.M., Rastrojo, A., Garde, E., Lopez, M.C., Thomas, M.C., and Aguado, B. (2017). Dataset for distribution of SIDER2 elements in the Leishmania major genome and transcriptome. Data Brief 11, 39-43. PMID: 28127581
    • Solana, J.C., Ramirez, L., Corvo, L., de Oliveira, C.I., Barral-Netto, M., Requena, J.M., Iborra, S., and Soto, M. (2017). Vaccination with a Leishmania infantum HSP70-II null mutant confers long-term protective immunity against Leishmania major infection in two mice models. PLoS neglected tropical diseases 11, e0005644. PMID: 28558043
    • Nocua, P.A., Ramirez, C.A., Requena*, J.M., and Puerta*, C.J. (2017). Leishmania braziliensis SCD6 and RBP42 proteins, two factors with RNA binding capacity. Parasites & vectors 10, 610. *C.A. PMID: 29258569
    • Gonzalez-de la Fuente, S., Peiro-Pastor, R., Rastrojo, A., Moreno, J., Carrasco-Ramiro, F., Requena*, J.M., and Aguado*, B. (2017). Resequencing of the Leishmania infantum (strain JPCM5) genome and de novo assembly into 36 contigs. Sci Rep 7, 18050. *C.A. PMID: 29273719
    • Diaz, J.R., Ramirez, C.A., Nocua, P.A., Guzman, F., Requena, J.M., and Puerta, C.J. (2018). Dipeptidyl peptidase 3, a novel protease from Leishmania braziliensis. PLoS One 13, e0190618. PMID: 29304092

 

Libros:

Stress Response in Microbiology. Caister Academic Press. Editor: Jose M. Requena. June 2012. ISBN: 978-1-908230-04-1. NLM ID: 101587947


 

Patentes:

Jose M. Requena Rolanía, J.M., Cristina Folgueira Fernández, C., Carrión Herrero, J. y Manuel Fresno Escudero, M. (2010) Use of strains of Leishmania ΔHSP70-II as a vaccine. Universidad Autónoma de Madrid. PCT/ES2010/070073.

¡Atención! Este sitio usa cookies y tecnologías similares.

Si no cambia la configuración de su navegador, usted acepta su uso. Saber más

Acepto

POLÍTICA DE COOKIES

¿Qué son las cookies?

Una cookie es un fichero que se descarga en su ordenador al acceder a determinadas páginas web. Las cookies permiten a una página web, entre otras cosas, almacenar y recuperar información sobre los hábitos de navegación de un usuario o de su equipo y, dependiendo de la información que contengan y de la forma en que utilice su equipo, pueden utilizarse para reconocer al usuario.

Tipos de cookies

A continuación, se realiza una clasificación de las cookies en función de una serie de categorías. No obstante es necesario tener en cuenta que una misma cookie puede estar incluida en más de una categoría.

  1. Tipos de cookies según la entidad que las gestione

    Según quien sea la entidad que gestione el equipo o dominio desde donde se envían las cookies y trate los datos que se obtengan, podemos distinguir:

    • Cookies propias: son aquéllas que se envían al equipo terminal del usuario desde un equipo o dominio gestionado por el propio editor y desde el que se presta el servicio solicitado por el usuario.
    • Cookies de terceros: son aquéllas que se envían al equipo terminal del usuario desde un equipo o dominio que no es gestionado por el editor, sino por otra entidad que trata los datos obtenidos través de las cookies. En el caso de que las cookies sean instaladas desde un equipo o dominio gestionado por el propio editor pero la información que se recoja mediante éstas sea gestionada por un tercero, no pueden ser consideradas como cookies propias.

  2. Tipos de cookies según el plazo de tiempo que permanecen activadas

    Según el plazo de tiempo que permanecen activadas en el equipo terminal podemos distinguir:

    • Cookies de sesión: son un tipo de cookies diseñadas para recabar y almacenar datos mientras el usuario accede a una página web. Se suelen emplear para almacenar información que solo interesa conservar para la prestación del servicio solicitado por el usuario en una sola ocasión (p.e. una lista de productos adquiridos).
    • Cookies persistentes: son un tipo de cookies en el que los datos siguen almacenados en el terminal y pueden ser accedidos y tratados durante un periodo definido por el responsable de la cookie, y que puede ir de unos minutos a varios años.

  3. Tipos de cookies según su finalidad

    Según la finalidad para la que se traten los datos obtenidos a través de las cookies, podemos distinguir entre:

    • Cookies técnicas: son aquéllas que permiten al usuario la navegación a través de una página web, plataforma o aplicación y la utilización de las diferentes opciones o servicios que en ella existan como, por ejemplo, controlar el tráfico y la comunicación de datos, identificar la sesión, acceder a partes de acceso restringido, recordar los elementos que integran un pedido, realizar el proceso de compra de un pedido, realizar la solicitud de inscripción o participación en un evento, utilizar elementos de seguridad durante la navegación, almacenar contenidos para la difusión de videos o sonido o compartir contenidos a través de redes sociales.
    • Cookies de personalización: son aquéllas que permiten al usuario acceder al servicio con algunas características de carácter general predefinidas en función de una serie de criterios en el terminal del usuario como por ejemplo serian el idioma, el tipo de navegador a través del cual accede al servicio, la configuración regional desde donde accede al servicio, etc.
    • Cookies de análisis: son aquéllas que permiten al responsable de las mismas, el seguimiento y análisis del comportamiento de los usuarios de los sitios web a los que están vinculadas. La información recogida mediante este tipo de cookies se utiliza en la medición de la actividad de los sitios web, aplicación o  lataforma y para la elaboración de perfiles de navegación de los usuarios de dichos sitios, aplicaciones y plataformas, con el fin de introducir mejoras en función del análisis de los datos de uso que hacen los usuarios del servicio.

Cookies utilizadas en nuestra web

La página web del CBMSO utiliza Google Analytics. Google Analytics es una herramienta sencilla y fácil de usar que ayuda a los propietarios de sitios web a medir cómo interactúan los usuarios con el contenido del sitio. Puede consultar más información sobre las cookies utilizadas por Google Analitycs en este enlace.

Aceptación de la Política de cookies

El Centro de Biología Molecular Severo Ochoa asume que usted acepta el uso de cookies si continua navegando al considerar que se trata de una acción consciente y positiva de la que se infiere el consentimiento del usuario. En tal sentido se le informa previamente de que tal conducta será interpretada en el sentido de que acepta la instalación y utilización de las cookies.

Ante esta información es posible llevar a cabo las siguientes acciones:

Cómo modificar la configuración de las cookies

Usted puede restringir, bloquear o borrar las cookies de cualquier página web, utilizando su navegador. En cada navegador la operación es diferente, aquí le mostramos enlaces sobre este particular de los navegadores más utilizados: